自南阳建政开始，李弘基开始重视军队的正规化建设，在军中建立一套赏罚分明的制度。只是迫于当时的形势，闯军又一直处于战争状态，李弘基只得暂时将闯军分为旧军和新军。所谓旧军，就是采用已有的军队编制和操练方法，而新军则是李弘基按照现代军队编制和训练方法组建的新型军队，也就是袁宗第领导的新军营。
纪律严明，赏罚分明，乃是一支军队成功的基石。明军之所以从开国之初的精锐之士到现在几乎屡战屡败，关外打不赢清军，关内面对农民军也是剿而无力，最重要的原因，就是明军建立的基石已经烂掉，更是被百姓骂作官匪。
有了明军的前车之鉴，李弘基要求各级军官，对部下必须赏罚分明，不得贪墨其功，也不得侵占其赏赐。为此，李弘基还在军中安排巡视官，不定期开展巡视，及时纠正军中出现的各种不公平现象，从而提升将士对闯军的向心力和凝聚力。由于巡视官独立于各军，与执法队一样，只受牛金星节制，避免军中将领插手干预，确保绝对公平。
根据李弘基的军令，当军中将官职位出现空缺时，以军功大小作为提拔军官的标准，严禁私相授受，一旦发现违规，将进行严惩。
闯军军功主要以杀敌多少衡量，分为集体功和个人功。由于战场形势极为复杂，特别是火器的大量使用，当无法计算个人军功时，就采用集体功来表示，为一个战斗单位共有。而个人功则由单一个人所有，最容易衡量个体的军功，也最容易获得将士认可，成为提拔将士主要参考。
为了及时统计将士的军功，闯军出战前还会有军法官同行，有利于在战后统计军功，减少不必要的争执。战事结束后，军法官会将立功将士名单留存一份外，上交元帅府备案，作为元帅府赏赐将士的依据。
为了让赏赐实至名归，防止出现冒领冒用，各军出征前，必须向元帅府提交出征人员花名册备案，以供查询。立功将士的赏赐以花名册为准，特殊情况需向元帅府说明原因，否则元帅府将不发放赏赐。
攻下襄阳后，由于军法官的存在，有功将士的名单就陆陆续续上报给了元帅府。由于战事紧张，赏赐还来不及发放，杨嗣昌就领大军进犯，为了歼灭杨嗣昌，将士们还没有等到赏赐发下来，就再次出征，使得元帅府只将留守将士的赏赐发下去。当然，作为攻破襄阳城的大功臣，秘间科的赏赐是第一时间发放，这次秘间科襄阳一战的有功人员，全部得到丰厚的赏赐，这使得秘间科的人员工作更有干劲。
按照闯军的规定，赏赐分为元帅府赏赐和地方赏赐。元帅府赏赐：所有出征人员都可获得10两银子的赏赐，相当于开拔银，阵亡或因病因故死亡的兵士则有50两银子的抚恤银，军官标准会更高，从100两到1000两不等，而有功将士，将按照功劳的大小，再另行赏赐，各级军官，赏赐主要与其部所立军功息息相关，所部军功大，赏赐自然也就越丰厚，这种相对公平的做法使得闯军上下都比较满意。地方赏赐：每占领一地后，征用当地府库的三成用以奖赏有功将士。
在李弘基回襄阳前，田见秀已经领兵2万，与袁宗第的新军营先行返回襄阳。李弘基回到襄阳后，立即对这些将士进行赏赐。
这些将士中，除了刚刚编入闯军的官军外，大部分将士既可获得襄阳一战的赏赐，还可获得与杨嗣昌一战以及郧阳一战的赏赐，这使得这些将士的赏赐极为丰厚，特别是新军营，与杨嗣昌一战表现尤为突出，所立军功要大大高于其他将士，获得的赏赐自然也非常高，这让刚刚加入闯军的官军极为羡慕，也激起了他们的好战之心。
在古代，军人可没有信仰，军人打仗卖命就是为了获得钱财，用以养家糊口。明军战斗力不高的一个重要原因，就是军饷一直不足，各级军官还克扣兵士的军饷，自然没有几个人愿意替上官和朝廷卖命。而明军中那些善战之军，军饷往往比较充足。李弘基也深谙这点，闯军要想走得长远，在没有信仰支撑的情况下，就必须以金钱和官位刺激将士的好战之心。
此次襄阳一战中，对于还没有领到赏赐的将士，除了刘宗敏仍在攻打荆州外，其他已经驻守当地的将士，李弘基要求元帅府立即按照花名册和立功名单，将这些赏赐尽快发到将士手中。
至于闯军将士一下子有了这么多钱财，会不会偷偷跑路，很多将士以前不过是流民或饥民，并不是职业军人，但李弘基一点不担心，军法对逃兵的处置非常严重，一旦发现就会枭首示众。而且，现在又逢乱世，人命贱如草芥，还真没有比当兵更好的出路。
虽然一下子就赏赐了将士们这么多的银子，但李弘基一点也不肉疼。在他看来，将士们手中有钱，就会拿出来消费，可以带动当地经济发展，从而增加当地税收，李弘基可是打算开征商税的。
李弘基突然想起刚刚攻下的汝宁，唐王和襄王的财富如此之多，汝宁的崇王肯定比他们少不了多少。毕竟，大明的藩王，被公认富得流油，成为人人想杀的肥猪。
李弘基立即派人将李岩请来，他想知道崇王的缴获有多少。如今，李弘基对各地府库不再关注，也不查封当地府库，除非特殊情况。现在的闯军以占领和巩固地盘为主，各地府库除了拿出三成用来奖赏有功将士外，非军需物资，基本留在当地，用以发展当地民生。
“林泉，补之有没有将崇王府的缴获清单报来？”李弘基问道。
“刚刚收到。我刚准备拿来给主公看，主公就派人传召了。”李岩笑着道。说完，李岩就将手中的公文递给李弘基。
李弘基一看，果然是崇王府的缴获清单。他看了一眼，心中非常高兴，虽然这次的缴获没有唐王和襄王多，但也算是富可敌国，仅白银就1000多万两，粮食100多万石，其他财物无数。
“你告诉补之，将士们的赏赐按照此前制定的标准进行，尽快将赏赐发下去。”李弘基高兴的吩咐道。
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