李弘基对众将的反应非常满意。闯军要想取得军事上的成功，这些最高将领的心态非常重要。只有积极进取的将领，才能取得一个又一个的军事胜利。
“诸位回去后，根据三三制原则，按照新军制对所辖军队进行重新整编，根据各级军官所辖人数，分配军队番号，尽快搭好框架，我会从新军营中抽调部分骨干予以协助，并担任教官，直到完成基本的训练。同时，我会将训练操典发给诸位，今后按照训练操典训练部队。等一个月的新兵训练期结束后，请各军军长派人与元帅府协商，将新兵补充进去，形成以老带新，尽快形成战斗力。冯雄，你的军队就整编进袁宗第的第10师。
诸位必须按照新军制整编军队，不得延误，否则军法从事。诸将要将军中老幼病残剔除出去，并按照要求在各地组建守备军。守备军的训练和编制，与正规军一样。刘宗敏、李过、田见秀、高一功、袁宗第、党守素、冯雄，你们七人镇守一方，一定要在3月中旬前完成各自区域守备军的组建。”李弘基道。
“末将领命！”
“刘体仁、刘芳亮，白旺！”
“属下在！”
“我现在命令，由刘体仁负责组建南阳各地守备军，刘芳亮负责组建襄阳各地守备军，白旺负责组建德安各地守备军！”
“谨遵大帅令旨！”刘体仁、刘芳亮、白旺站出来领命。
李弘基见今天的军事会议已经到了尾声，于是又继续说道：
“为了集中处理闯军各种大小军务，确保军事机密不被泄露，我将在元帅府设一个军机处，协助我处理各类军务。军机处隶属于元帅府，专事处理军务。李岩、牛金星、宋献策以及各军军长入军机处。由于各军军长长期驻军在外，军机处主要由李岩、牛金星、宋献策负责。今后，闯军各类军务，直接交由军机处理。”
众人应是。
“望诸位同心协力，共同将我们闯军的基业发展壮大。我李自成发誓，今后与诸位共富贵！”李弘基站起来向众人微微一躬道。
“属下一定不辜负大帅期望！”众人也纷纷站起来躬身一拜。
……
军事会议后，诸将返回各自的驻地，开始按照李弘基的命令，对所辖军队按照新军制进行整编。同时，开始组建辖区守备军。由于李弘基强调，守备军府城最高为守备旅，县为守备团。由于闯军在各地都有重兵驻守，即使城内有事，军队也能迅速到位，于是诸将为省事，尽快完成整军和守备军的建设，干脆将地方上的守备军一律设为守备团，由守军转变而成。不过，这些地方的府城仍保留守备旅的编制，待整军完成后，由守备旅旅长再行招募，完成满编。
李弘基自然看在眼里，对诸将做法表示欢迎。只要守备军与野战军编制一样，随时可以将守备军补充进野战军，守备军将成为野战军的后备力量，李弘基何乐不为。
为了让各地顺利完成整军，李弘基从新军营中抽出大批骨干，奔赴各地，指导整军，并对整军后的闯军按照新军制重新进行训练。
由于新军营攻打承天时，并没有在各地派兵留守，而是由罗虎率领的接受部队占领城池。因此，袁宗第将承天各地守备部队的组建交给罗虎负责。由于罗虎出自孩儿兵，也是孩儿兵的统领之一，而孩儿兵早就按照新军制完成编制和建设。罗虎从孩儿兵中调一些人过来，协助他完成承天地方守备部队的组建和训练。
袁宗第将重心放在与汉阳冯雄的驻军整合上，由于承天毗邻汉阳，而汉阳只有两县，因此承天和汉阳是最先完成整军和守备军的组建。
为了防止官军探听闯军虚实，从而趁机攻打闯军，闯军这次大规模的整军，都是在保密状态下开展。而各地超过守备军编制规模的守军，也陆陆续续调走，与相邻驻军一起进行整编。
而野战军和守备军各级军官的人选，都是以现有军官为基础，这些军官基本都官升一级，军功大的，官升数级。新军营采取的新兵大比武，从新兵中选拔部分基层军官的举措，这次没有再实行。由于元帅府有各级军官名单，所立军功及大小也历历在目，团以下军官任命，直接由元帅府批准即可，而团以上军官任命，必须得到李弘基的批准。
闯军草创，军中将领大部分都是起兵之初就开始追随李弘基的，对李弘基及闯军都忠心耿耿。因此，李弘基一般不会卡这些军官的任命。但李弘基还是将诸将上报的军官进行平级对调，他可不想让军中将领因长期一起共事，结成一个同盟，从而影响自己在军中的威信。他要不断的在各军中掺沙子，不能成为某些大将的一言堂。李弘基相信这些闯军将领的忠诚，但随着地位的变化，难免不会有别的心思。
历史上，李自成虽然后来当了皇帝，坐上龙座，但实际上已经无法控制闯军。李自成不是不知道追赃助饷扩大化的危害，但他已经控制不了局势，他的命令甚至出不了皇宫，实际上被刘宗敏等一批将领架空了，这也是他失败的一个重要原因。刘宗敏这些将领，早期对李自成忠诚，那是无需置疑的。但随着闯军一个又一个军事上的胜利，这些将领开始膨胀，变得难以驾驭，对李自成的忠诚仅限于拥戴他做皇帝。
李弘基要想避免历史的悲剧重演，必须从现在开始就将军队牢牢控制在手中，不能让一家多大，要雨露均沾，使得单个将军的威信无法与他抗衡。
李弘基还要在军中营造出，闯军之所以取得胜利，与李弘基分不开，从而养成将士的绝对服从命令，而不是对他的命令产生质疑。自南阳建政以来，李弘基通过一系列举措，加上军事上的大获全胜，这让李弘基的威信越来越高，军中将士开始对他绝对服从。这从他轻易就收回军中将领的任免权可见一斑。
3月上旬，闯军各地驻军陆续完成整军，各地守备军也完成组建。3月中旬，新兵陆续下到各军，各军得以充实，兵员得到补充，闯军共完成第十军到第十八军共九个军的组建。
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