平定黄巾的主角就是汉末三将——皇甫嵩、卢植和朱儁了，这三人不仅在黄巾之乱中大放异彩，还与三国的主要奠基人有着很深的联系，曹操曾与皇甫嵩一同平定颍川的黄巾军，刘备是卢植的学生，孙坚是朱儁的下属。
虽然主角已经登场，但是战事却并不乐观，卢植在北方防线与张角僵持不下，朱儁首战就被黄巾将领波才所败，只能和皇甫嵩一同防守长社，但是波才率领大军围城，汉军人少，再加上首战失利，军中士气低落。这时，东汉末年的压轴人物——曹操，终于千呼万唤始出来了，被灵帝派去增援皇甫嵩。
皇甫嵩和朱儁怎么说也是汉末名将，虽然局势不利，但是朝廷正规军对付以农民为主的起义军还是绰绰有余的，未等到援军到来，皇甫嵩就想好了破敌之法。在黄昏时吹起了大风，皇甫嵩命令士兵手持火把悄悄出城，把黄巾军营寨周围的杂草点燃，用火攻发起反击，率军冲入敌阵。起义军大都是农民，没有经过专业的训练，哪见过这种阵仗，顷刻间阵脚大乱，四处奔走，恰好这时曹操率领援军赶到，看着乱作一团的起义军，汉军一个个眼里放光，这哪是叛军啊，分明是行走的赏钱啊，一个个都比见了自己亲爹还要亲，接下来，就是汉军单方面的屠杀了。此战斩杀黄巾军数万人，汉军士气大振。与此同时，另一战线上的卢植也没闲着，很明显，医生兼道士兼起义总指挥的张角对上受过正儿八经高等教育的卢植显得处处尽落下风，屡战屡败，被斩杀了万余人，连巨鹿都丢了，无奈之下只能退守广宗，坚守不出。
张角还没从刚开始时起义军势不可挡的喜悦中回过神来，现实就狠狠的给了他两耳光，并在他耳边冷冷的说了句：“该醒醒了！”他想破脑袋也想不出，连同自己在内的几十万的军队中，且不说可以和皇甫嵩、卢植、朱儁抗衡的将领了，连个像样的人才都没有!甚至张三李四王麻子在衙门里当过几天差，听人讲起过几句孙子兵法，就被安排做了一方首领，起义军在作战过程中，连一些基本的军事常识都不懂，更别提什么战略部署、奇谋制胜了，作战方式基本上就两种——坚守不出、围敌不进。张角总算明白了自己这边除了人数上有优势，其他再无一点优势。战争不是打群架，不是靠人多就能赢的。
可是现实不会给张角时间伤感，就算有，卢植也不会同意，他现在正率领着军队在广宗城外攻城呢。卢植采用稳扎稳打的方法攻城，挖战壕，造云梯，一切都在有条不紊的进行，可见专业的和业余的还是有很大差距的。眼看破城在即，卢植也即将斩杀张角，成为平叛黄巾中的最大功臣，事情却出现了转机，而这次影响战局的，同样是一个不起眼的小人物。
由于各方战线均传来捷报，京城的危机也解除了，一切都朝着好的方向发展。但是，一般情况下，当一切都进行的很顺利时候，就会有人跳出来制造些麻烦，于是，我们的皇帝大人又要开始作妖了，不对，应该说皇帝大人关心前线战事，派人前来视察情况，这种行为大家也都表示理解，但是让人理解不了的是，去前线督战，就算不派个都尉、将军，怎么说也得是个正儿八经的大臣吧，最起码得懂些军事吧，刘宏先生派个宦官去是几个意思啊，难不成还要让他给前线的战士传授几招葵花宝典用以退敌？
虽然刘皇帝在选人方面犯了迷糊，但是被委以重任的左丰先生却头脑清醒得很，明确的知道自己此行的目的。到了前线，左先生先好吃好喝的享受几天，接下来就直奔主题了，张嘴第一件事就是冲卢植要钱。卢植一听这话，火气瞬间上来了，老子在前线拼死拼活，有的士兵连饭都吃不饱，你一来就冲我要钱?于是几句话就把左丰打发走了。
由于在卢植那里吃了闭门羹，左丰怀恨在心，回到洛阳后对灵帝说：“广宗的叛军不过是一些乌合之众，很容易攻破，但是卢植故意拖着不发起进攻，整天在军营里享受，简直是居心叵测。”灵帝本来就担心平定叛军后各地将领拥兵自重，再加上左丰这么一说，更是认为自己的猜测不无道理，于是派人连夜将卢植用囚车押解回来，幸得皇甫嵩求情，卢植才逃过一死，灵帝又任命董卓代替卢植的位置。临阵换将，这是兵家大忌！此举不仅影响前线士兵的士气，还给了张角一丝喘息的机会。
转眼过去了三个月，董卓这边可谓是没有一点进展，反观另一战线的皇甫嵩则是捷报连连，皇甫嵩在苍亭擒获卜已，斩杀七千多人。为了尽快结束战争，灵帝派遣皇甫嵩征讨张角，皇甫嵩接到这一命令，也是十分激动，卢植未能完成的任务即将在自己的手上终结，张角的首级也将要成为自己建功立业的垫脚石。可是，历史总是充满了遗憾，皇甫嵩的希望也随着张角的死亡而破灭，这一战注定无法进行了。
长期的奔走行医，组织起义，累垮了张角的身体，而起义军的连连战败更是让他心力交瘁，最终，这位起义的总指挥卧病不起。张角早年间行医救治了不少人，而现在对于自己的身体却是无能为力，悬壶济世，救得了病，救不了命，命该如此，即使心有不甘，张角还是在黄巾起义爆发的八个月后怀着遗憾病逝了，至此，东汉末年一代风云人物就此谢幕。
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