但这起诬告事件，却加深了幕府对平户藩的疑虑。
之后，松平信纲假借顺道路过平户藩，并发现了平户藩因与荷兰之间的垄断贸易，而拥有了十分强大军事实力后，使得幕府开始了对平户藩加强警戒和连番制裁。
1641年，作为贸易窗口的平户商馆，被幕府强令转移到了长崎的出岛。
随着平户商馆转移，原本富裕的平户藩失去了巨大的经济来源，藩内财政瞬间变得日益困难起来，许多武士也因此而失去土地和破产。
为了缓解这一不利的局面，松浦重信开始推行以殖产兴业和新田开发为主的的藩政改革,改革最终获得了成功，使得这一改革被称为：九州第一善治良政。
同时，为了进一步打消幕府的顾忌，松浦重信又把蕃府迁到了长崎。
德川幕府为了稳固自己的统治地位，可谓无所不用其极。
首先，降低了大名的资格。
凡俸禄位于一万石以上的武士都可拥有自己的领地，建立自己的城堡，成为大名。
于是，江户时代整个日本的大名数量迅速达到了200多家。
幕府的心思实在是精明，这样一来，会有更多的人对自己感恩戴德；同时，由于大名的力量被分散和稀释。再没有任何一个大名可以独立和幕府进行抗衡。
此举有点类似中国西汉初年的‘推恩令’，最终造成的结果就是：幕府将军一家独大。
其次，设立复杂的官僚机构来维护和平，以便更为有效地进行统治。而谱代大名则在官僚机构中担任重要角色，与其说是与大名们分享权力，不过是变相地对大名进行利用和奴役。
这些平日里在日本国内显得‘老实巴交’的外样大名，内心则不一定真的对幕府服服帖帖。
既然在国内被幕府压制，难有作为，倒不如向外发展，寻求出路。比较有名的就是九州岛南部的萨摩藩，不但靠着发展海洋贸易实现了发家致富，还通过武力迫使中国的藩属国琉球臣服于它。
最后，限制各藩修建城堡，禁止结党，规定：婚姻需经幕府批准。甚至还定下了‘参觐交代制’，令：大名隔一年在江户和领地轮住。回领地时，妻、子则需留在江户为人质。
而旅途舟车和在江户生活的庞大开支，不断消耗着大名们的财力。
随李星波同行的，还有平户犬养亲信和李星波找到向导。
等那些武士的一天，李星波可没闲着，他分别命多人寻访，绘出了多份周边的地图。其中，以前往长崎和长崎的地图最详细。
半夜出发，天不亮就到了长崎。
长崎港同样如临大军压境，一派紧张气氛。
李星波毫无顾忌地走下船，平户犬养的亲信犬养锡则急忙给码头的管事递上名帖，并说明来意。
“既是货船不去出岛，来这里干嘛？”管事毫不通融的说道：“赶紧离开这里，否则别怪我不客气！”
犬养锡回头看看李星波，完全没有走的意思，只能拿出十两银子，偷偷塞给管事：“管事大人，这些都是平户藩蕃主松浦重信的私人物品，还请大人通融通融！”
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