时间背景为不远的未来，随着科学技术的日新月异，人类已经不局限在我们现有的物质空间进行探索，而是将好奇心的触角伸到了更多的未知领域。
多年前一次充满神秘色彩的科学考察中，中元科技研究所的几位创始人，意外发现了在我们这个物质空间周围，还共存着一个本元的空间。
经过深入的实验，研究所找到了可以通过设备，让物质空间的人类本元进入本元空间的方法，从此正式展开了针对本元及其相关领域的科学研究。
因为在研究所工作的妻子无端被害，为了解救妻子，成方冒险进入本元空间。
通过自己对本元空间的逐步了解，一层层揭开了这个神奇的本元空间与我们的物质空间之间的微妙联系。
由此，成方，以及一个传承了数千年的家族门派，和掌握尖端科技的神秘研究所，三者之间的故事就这样展开了。